Les Philippines se situent au cœur du Triangle de corail, la région marine la plus biodiverse de la planète, contenant environ 76 % des espèces de coraux connues et un pourcentage exceptionnel d’espèces de poissons récifaux mondiaux, bien plus que dans les Caraïbes ou d’autres zones tropicales comparables. Les données scientifiques montrent que pour chaque unité de surface, la densité et la diversité des espèces marines (coraux durs et mous, poissons, crabes, éponges, tortues marines, raies, requins et fossiles vivants tels que les coelacanthes) y sont parmi les plus élevées au monde.

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Des sites emblématiques comme le Parc marin du récif de Tubbataha, classé Patrimoine mondial de l’UNESCO, présentent des centaines d’espèces de coraux et poissons, de grands pélagiques et de rares tortues dans des écosystèmes bien préservés. Cette diversité remarquable fait de l’archipel une destination de plongée scientifiquement incontournable, où un plongeur expérimenté ou non peut observer une large gamme d’interactions écologiques, d’endémisme et de comportements sous-marins difficiles à trouver ailleurs sur Terre.